Aunque legalmente la Fundación César Manrique (FCM) se constituyó en 1983 -Fundación Amigos de Lanzarote, se denominaba entonces-, no es hasta el año 1990 cuando un equipo de colaboradores próximos a César Manrique se pone a trabajar en la actualización del proyecto fundacional. La adaptación y modificación de los antiguos estatutos se ve complementada con la remodelación de la vivienda del artista (Taro de Tahíche), que se recicla en museo y sede de la FCM y, simultáneamente, con el diseño del modelo económico y cultural del proyecto fundacional.

El nombramiento de los órganos de gobierno va precedido por la constitución de un Patronato de Honor, presidido por S.M. La Reina Doña Sofía. Entre tanto, César Manrique nombra el Patronato rector de la institución, que es dotada, también, de equipo ejecutivo y de recursos humanos.

El proceso constituyente culmina el 27 de marzo de 1992, con la inauguración oficial de la FCM en su actual sede, estando presente el entonces ministro de Cultura Jordi Solé Tura. Sólo seis meses más tarde desaparecía el fundador.